این مرکز در اوایل سال ۱۳۸۳ در پایگاه پژوهشی میراث فرهنگی شهر تاریخی یزد تاسیس گردیده است. با توجه به میزان گستردگی خسارت موریانه ها در اکثر بناهای تاریخی شهر یزد، این مرکز در ابتدای فعالیت خود کنترل موریانه ها را در بنای تاریخی بقعه ی سید شمس الدین (معروف به مدرسه شمسیه) شروع نمود. در این راستا ۳ گونه موریانه با نام های علمی Anacanthotermes vagans، Microcerotermes sp. و Amitermes vilis شناسایی شدند. این موریانه ها متعلق به گروه موریانه های زیرزمینی یا Subterranean termites می باشند.